Beliau meraih kejuaraan liga Jerman bersama 1. FC Köln pada tahun 1962 dan dianugerahkan Pemain Bola Sepak Terbaik Jerman pada tahun sama berikutan sumbangan beliau kepada pasukan kebangsaan di Piala Dunia serta turut sebahagian daripada "World Cup Dream Team XI". Beliau berpindah ke Itali ntuk sertai kelab Mantova. Beliau melakukan penampilan sulungnya di Serie A ketika menentang Milan dan perlawanan berkesudahan Mantova menang mengejut 4-1. Walau bagaimanapun, beliau bermain di Mantova hanya satu musim apabila Roma membawa masuk Schnellinger pada tahun 1964. Di Roma, beliau merangkul Coppa Italia pada tahun sama. Setahun kemudian, beliau meraih Coppa Italia buat kali kedua tetapi bersama kelab Milan. Beliau kekal selama sembilan musim bersama Rossoneri dengana menyaksikan beberapa kejayaan peringkat domestik mahupun Eropah. Beliau menjadi salah satu pemain bola sepak Jerman cemerlang yang beraksi di luar negara.